Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Senp3Q9EP97 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Senp3Q9EP97 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Senp3Q9EP97 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Senp3Q9EP97 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Senp3Q9EP97 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Senp3Q9EP97 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Senp3Q9EP97 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Senp3Q9EP97 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Senp3Q9EP97 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Senp3Q9EP97 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Senp3Q9EP97 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Senp3Q9EP97 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Senp3Q9EP97 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Senp3Q9EP97 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Senp3Q9EP97 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Senp3Q9EP97 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Senp3Q9EP97 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Senp3Q9EP97 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Senp3Q9EP97 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Senp3Q9EP97 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Senp3Q9EP97 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Senp3Q9EP97 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Senp3Q9EP97 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Senp3Q9EP97 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Senp3Q9EP97 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Senp3Q9EP97 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Senp3Q9EP97 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Senp3Q9EP97 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Senp3Q9EP97 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Senp3Q9EP97 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Senp3Q9EP97 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Senp3Q9EP97 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Senp3Q9EP97 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Senp3Q9EP97 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Senp3Q9EP97 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Senp3Q9EP97 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Senp3Q9EP97 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Senp3Q9EP97 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Senp3Q9EP97 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Senp3Q9EP97 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Senp3Q9EP97 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Senp3Q9EP97 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Senp3Q9EP97 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Senp3Q9EP97 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Senp3Q9EP97 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Senp3Q9EP97 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Senp3Q9EP97 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Senp3Q9EP97 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Senp3Q9EP97 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Senp3Q9EP97 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Senp3Q9EP97 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Senp3Q9EP97 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Senp3Q9EP97 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Senp3Q9EP97 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Senp3Q9EP97 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Senp3Q9EP97 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Senp3Q9EP97 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Senp3Q9EP97 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Senp3Q9EP97 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Senp3Q9EP97 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Senp3Q9EP97 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Senp3Q9EP97 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Senp3Q9EP97 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Senp3Q9EP97 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Senp3Q9EP97 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Senp3Q9EP97 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Senp3Q9EP97 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Senp3Q9EP97 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Senp3Q9EP97 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Senp3Q9EP97 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Senp3Q9EP97 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Senp3Q9EP97 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Senp3Q9EP97 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Senp3Q9EP97 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Senp3Q9EP97 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Senp3Q9EP97 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Senp3Q9EP97 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Senp3Q9EP97 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Senp3Q9EP97 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Senp3Q9EP97 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Senp3Q9EP97 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Senp3Q9EP97 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Senp3Q9EP97 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Senp3Q9EP97 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Senp3Q9EP97 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Senp3Q9EP97 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Senp3Q9EP97 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Senp3Q9EP97 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Senp3Q9EP97 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Senp3Q9EP97 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Senp3Q9EP97 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Senp3Q9EP97 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Senp3Q9EP97 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Senp3Q9EP97 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Senp3Q9EP97 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Senp3Q9EP97 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Senp3Q9EP97 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Senp3Q9EP97 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Senp3Q9EP97 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms