Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAA3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9DAA3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DAA3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9DAA3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9DAA3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9DAA3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9DAA3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9DAA3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAA3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9DAA3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9DAA3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9DAA3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9DAA3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9DAA3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9DAA3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9DAA3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9DAA3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DAA3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9DAA3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9DAA3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9DAA3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9DAA3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DAA3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9DAA3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DAA3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DAA3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DAA3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DAA3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DAA3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms