Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc178Q8CDV0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc178Q8CDV0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc178Q8CDV0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc178Q8CDV0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc178Q8CDV0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc178Q8CDV0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc178Q8CDV0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc178Q8CDV0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc178Q8CDV0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc178Q8CDV0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc178Q8CDV0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc178Q8CDV0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc178Q8CDV0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc178Q8CDV0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc178Q8CDV0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc178Q8CDV0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ccdc178Q8CDV0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc178Q8CDV0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc178Q8CDV0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc178Q8CDV0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc178Q8CDV0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc178Q8CDV0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc178Q8CDV0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc178Q8CDV0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc178Q8CDV0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc178Q8CDV0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc178Q8CDV0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc178Q8CDV0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc178Q8CDV0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc178Q8CDV0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc178Q8CDV0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc178Q8CDV0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc178Q8CDV0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc178Q8CDV0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc178Q8CDV0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc178Q8CDV0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc178Q8CDV0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc178Q8CDV0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc178Q8CDV0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc178Q8CDV0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc178Q8CDV0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc178Q8CDV0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc178Q8CDV0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc178Q8CDV0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc178Q8CDV0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc178Q8CDV0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc178Q8CDV0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc178Q8CDV0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc178Q8CDV0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc178Q8CDV0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc178Q8CDV0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc178Q8CDV0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc178Q8CDV0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc178Q8CDV0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc178Q8CDV0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc178Q8CDV0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc178Q8CDV0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc178Q8CDV0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc178Q8CDV0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc178Q8CDV0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc178Q8CDV0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc178Q8CDV0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc178Q8CDV0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc178Q8CDV0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc178Q8CDV0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc178Q8CDV0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc178Q8CDV0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc178Q8CDV0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc178Q8CDV0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc178Q8CDV0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc178Q8CDV0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc178Q8CDV0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc178Q8CDV0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc178Q8CDV0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc178Q8CDV0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc178Q8CDV0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc178Q8CDV0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc178Q8CDV0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms