Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3dQ8BX13 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube3dQ8BX13 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3dQ8BX13 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ube3dQ8BX13 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3dQ8BX13 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ube3dQ8BX13 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ube3dQ8BX13 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3dQ8BX13 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3dQ8BX13 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3dQ8BX13 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ube3dQ8BX13 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3dQ8BX13 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3dQ8BX13 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ube3dQ8BX13 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube3dQ8BX13 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube3dQ8BX13 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube3dQ8BX13 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3dQ8BX13 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms