Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prm3Q62100 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prm3Q62100 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prm3Q62100 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prm3Q62100 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prm3Q62100 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prm3Q62100 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prm3Q62100 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prm3Q62100 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prm3Q62100 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prm3Q62100 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prm3Q62100 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prm3Q62100 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prm3Q62100 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prm3Q62100 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prm3Q62100 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prm3Q62100 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prm3Q62100 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prm3Q62100 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prm3Q62100 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prm3Q62100 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prm3Q62100 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prm3Q62100 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prm3Q62100 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prm3Q62100 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prm3Q62100 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prm3Q62100 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prm3Q62100 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prm3Q62100 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prm3Q62100 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prm3Q62100 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prm3Q62100 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prm3Q62100 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prm3Q62100 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prm3Q62100 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prm3Q62100 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms