Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ActbP60710 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ActbP60710 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ActbP60710 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ActbP60710 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ActbP60710 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ActbP60710 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ActbP60710 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ActbP60710 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ActbP60710 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ActbP60710 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ActbP60710 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ActbP60710 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ActbP60710 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ActbP60710 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ActbP60710 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ActbP60710 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ActbP60710 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ActbP60710 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ActbP60710 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ActbP60710 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ActbP60710 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ActbP60710 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ActbP60710 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ActbP60710 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ActbP60710 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ActbP60710 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ActbP60710 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ActbP60710 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ActbP60710 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ActbP60710 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ActbP60710 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ActbP60710 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ActbP60710 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ActbP60710 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ActbP60710 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ActbP60710 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ActbP60710 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ActbP60710 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ActbP60710 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ActbP60710 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ActbP60710 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ActbP60710 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ActbP60710 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ActbP60710 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ActbP60710 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ActbP60710 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ActbP60710 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ActbP60710 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ActbP60710 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ActbP60710 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ActbP60710 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ActbP60710 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ActbP60710 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ActbP60710 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ActbP60710 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ActbP60710 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ActbP60710 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ActbP60710 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ActbP60710 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ActbP60710 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ActbP60710 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ActbP60710 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ActbP60710 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ActbP60710 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ActbP60710 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ActbP60710 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ActbP60710 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ActbP60710 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ActbP60710 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ActbP60710 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ActbP60710 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ActbP60710 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ActbP60710 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ActbP60710 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ActbP60710 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ActbP60710 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ActbP60710 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ActbP60710 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ActbP60710 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ActbP60710 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ActbP60710 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ActbP60710 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ActbP60710 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ActbP60710 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ActbP60710 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ActbP60710 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ActbP60710 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ActbP60710 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ActbP60710 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ActbP60710 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ActbP60710 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ActbP60710 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ActbP60710 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ActbP60710 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ActbP60710 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ActbP60710 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ActbP60710 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ActbP60710 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ActbP60710 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268.8 ms