Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5eP56382 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp5eP56382 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5eP56382 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp5eP56382 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5eP56382 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp5eP56382 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5eP56382 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms