Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcl2P10889 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxcl2P10889 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcl2P10889 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxcl2P10889 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl2P10889 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl2P10889 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl2P10889 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl2P10889 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxcl2P10889 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl2P10889 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxcl2P10889 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl2P10889 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl2P10889 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl2P10889 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxcl2P10889 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl2P10889 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxcl2P10889 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxcl2P10889 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cxcl2P10889 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cxcl2P10889 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcl2P10889 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcl2P10889 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcl2P10889 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cxcl2P10889 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cxcl2P10889 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms