Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm28305F6U473 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm28305F6U473 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28305F6U473 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm28305F6U473 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28305F6U473 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms