Protein–RNA interactions for Protein: A9Z055

H2al2b, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al2bA9Z055 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al2bA9Z055 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al2bA9Z055 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al2bA9Z055 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2al2bA9Z055 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al2bA9Z055 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al2bA9Z055 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al2bA9Z055 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al2bA9Z055 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al2bA9Z055 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al2bA9Z055 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al2bA9Z055 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al2bA9Z055 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al2bA9Z055 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al2bA9Z055 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al2bA9Z055 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al2bA9Z055 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al2bA9Z055 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al2bA9Z055 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al2bA9Z055 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al2bA9Z055 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2al2bA9Z055 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2al2bA9Z055 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2al2bA9Z055 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms