Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Hdac5Q9Z2V6 L1td1-202ENSMUST00000154279 2942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Rtkn2-202ENSMUST00000105437 3932 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Cga-202ENSMUST00000108130 609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm15009-201ENSMUST00000121387 322 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Pitpnm2os2-202ENSMUST00000162577 744 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms