Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Pdpk1Q9Z2A0 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Pdpk1Q9Z2A0 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Pdpk1Q9Z2A0 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Pdpk1Q9Z2A0 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Pdpk1Q9Z2A0 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms