Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Ccdc141-202ENSMUST00000049544 8969 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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OtofQ9ESF1 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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