Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Rnf6Q9DBU5 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Rnf6Q9DBU5 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Rnf6Q9DBU5 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Rnf6Q9DBU5 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Rnf6Q9DBU5 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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