Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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Rnf17Q99MV7 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf17Q99MV7 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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