Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC153864.1-201ENSMUST00000218482 523 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23497-201ENSMUST00000157738 130 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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