Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Pcsk9Q80W65 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms