Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms