Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
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Usp49Q6P9L4 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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Usp49Q6P9L4 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
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Usp49Q6P9L4 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Usp49Q6P9L4 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp49Q6P9L4 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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