Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm30270-201ENSMUST00000202675 524 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 9430073C21Rik-201ENSMUST00000145346 2173 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Slco2b1-203ENSMUST00000107088 4369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm2098-201ENSMUST00000189146 1763 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm44802-201ENSMUST00000208026 1916 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm40841-202ENSMUST00000222823 3989 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm44835-201ENSMUST00000205544 3181 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Stat1-212ENSMUST00000191435 2803 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Aqp9-203ENSMUST00000113570 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 1700034I23Rik-201ENSMUST00000099123 2348 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Pde10a-201ENSMUST00000024647 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Mroh4-202ENSMUST00000137963 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Rars2-201ENSMUST00000029968 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm17979-201ENSMUST00000196646 611 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AC124709.1-201ENSMUST00000227296 620 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Synj2-208ENSMUST00000115789 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Cnot2-202ENSMUST00000105265 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Adgrl3-218ENSMUST00000122037 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Gm12743-201ENSMUST00000126668 3700 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Supt20-202ENSMUST00000170552 1968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Uggt1-201ENSMUST00000046875 9033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Pard3b-203ENSMUST00000094906 7676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Clcn1Q64347 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms