Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Sdad1-203ENSMUST00000201143 2156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Rnf19a-203ENSMUST00000228358 3452 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Med12-202ENSMUST00000087956 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc18Q640L5 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms