Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
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