Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC105950.2-201ENSMUST00000220938 368 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Bdh2-202ENSMUST00000120397 1172 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm11662-201ENSMUST00000121389 1193 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm12121-201ENSMUST00000131630 500 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1392-201ENSMUST00000189851 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Nxpe1-ps-202ENSMUST00000210160 956 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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Sft2d1Q5SSN7 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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Sft2d1Q5SSN7 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 4930553J12Rik-201ENSMUST00000023648 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Bdh2-201ENSMUST00000029817 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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Sft2d1Q5SSN7 Gm8394-201ENSMUST00000079684 952 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Sft2d1Q5SSN7 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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