Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Klhl41-201ENSMUST00000100050 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Ltf-201ENSMUST00000035077 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Map4k4-218ENSMUST00000195860 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Drp2-202ENSMUST00000113224 4147 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm38066-201ENSMUST00000193223 1634 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Rasgef1c-201ENSMUST00000063444 3378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Ephx2-203ENSMUST00000225309 2032 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm3854-201ENSMUST00000207173 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm44998-201ENSMUST00000207091 1768 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm8596-201ENSMUST00000188004 792 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 Zg16-201ENSMUST00000051122 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm28249-203ENSMUST00000190011 1495 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 AC162467.2-201ENSMUST00000219397 2571 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Pttg1-204ENSMUST00000117446 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm5315-201ENSMUST00000204430 1897 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Sept2-214ENSMUST00000172165 3192 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 Trim9-201ENSMUST00000110520 4156 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Trim9-203ENSMUST00000167755 4559 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm6733-201ENSMUST00000118302 1920 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Lrrc43Q3V0L5 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm9305-201ENSMUST00000220962 599 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 Gm46342-201ENSMUST00000223411 602 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Lrrc43Q3V0L5 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms