Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Q3U6N9 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Q3U6N9 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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