Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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