Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms