Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ttc39dQ0VF76 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms