Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Siah1bQ06985 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms