Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SbdsP70122 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SbdsP70122 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SbdsP70122 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SbdsP70122 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SbdsP70122 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SbdsP70122 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SbdsP70122 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SbdsP70122 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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