Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Dbx1P52950 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms