Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprkP35822 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 B3galt5-202ENSMUST00000113800 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprkP35822 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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