Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprmP28828 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Inpp1-201ENSMUST00000027271 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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