Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TtrP07309 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TtrP07309 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms