Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Olfr654-203ENSMUST00000213984 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm8529-201ENSMUST00000183298 745 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms