Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Pde8b-210ENSMUST00000162412 4035 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Txk-202ENSMUST00000169534 2344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Pdzrn4-201ENSMUST00000035399 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Foxp3-204ENSMUST00000115740 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gpbp1-201ENSMUST00000047627 3694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Dcaf11-201ENSMUST00000072530 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Rab27a-203ENSMUST00000184146 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 D7Ertd443e-203ENSMUST00000172947 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Gpr83-201ENSMUST00000034408 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm3455-201ENSMUST00000204812 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Tnfaip1-202ENSMUST00000108277 3768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Tmem175-203ENSMUST00000120327 1811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 AC117656.3-203ENSMUST00000225007 1809 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Phactr4-203ENSMUST00000102568 4614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Rbm43-202ENSMUST00000102768 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Trak2-205ENSMUST00000174120 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Ints14-202ENSMUST00000170517 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 Calm5-201ENSMUST00000183198 589 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hdac5Q9Z2V6 1700030O20Rik-201ENSMUST00000185546 594 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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