Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm27197-201ENSMUST00000184325 479 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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Rnf4Q9QZS2 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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Rnf4Q9QZS2 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Rnf4Q9QZS2 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Thyn1-201ENSMUST00000039161 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Rnf4Q9QZS2 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 A230001M10Rik-202ENSMUST00000196720 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnf4Q9QZS2 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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