Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Fgfbp1-201ENSMUST00000061299 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Musk-205ENSMUST00000102893 3323 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Serpina1f-201ENSMUST00000021490 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Zmym5-201ENSMUST00000039812 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm45292-201ENSMUST00000211232 2207 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm14561-201ENSMUST00000117376 798 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm10651-201ENSMUST00000118212 609 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm17138-201ENSMUST00000165702 459 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm26977-201ENSMUST00000183151 996 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm42529-201ENSMUST00000201843 741 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 AC153500.1-201ENSMUST00000219794 625 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Tssk4-206ENSMUST00000228041 1217 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 4930442J19Rik-202ENSMUST00000157058 1721 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Adam5-202ENSMUST00000118419 2791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Stx8-203ENSMUST00000108675 1497 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Nmnat1-202ENSMUST00000105693 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Fhl1-205ENSMUST00000114773 2298 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm12987-201ENSMUST00000118562 489 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm12120-201ENSMUST00000125068 592 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Tle6-213ENSMUST00000151858 627 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm20765-201ENSMUST00000177792 795 ntAPPRIS P2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm21312-201ENSMUST00000179258 795 ntAPPRIS P2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
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