Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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Rnf6Q9DBU5 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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Rnf6Q9DBU5 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf6Q9DBU5 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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