Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms