Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NubplQ9CWD8 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms