Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Use1Q9CQ56 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms