Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Fmr1-206ENSMUST00000114657 4076 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf17Q99MV7 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms