Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7R7

Rfx6, DNA-binding protein RFX6, mousemouse

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Length 927 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx6Q8C7R7 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Rfx6Q8C7R7 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Rfx6Q8C7R7 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Rfx6Q8C7R7 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Rfx6Q8C7R7 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Rfx6Q8C7R7 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Rfx6Q8C7R7 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Rfx6Q8C7R7 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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