Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Usp54Q8BL06 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Usp54Q8BL06 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Usp54Q8BL06 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Usp54Q8BL06 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Usp54Q8BL06 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp54Q8BL06 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Usp54Q8BL06 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Usp54Q8BL06 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms