Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Prkaa2-201ENSMUST00000030243 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Ccdc88cQ6VGS5 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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