Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Q3U6N9 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms