Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Rpusd3Q14AI6 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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Rpusd3Q14AI6 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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Rpusd3Q14AI6 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms