Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm26649-201ENSMUST00000181595 3196 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Oca2-201ENSMUST00000032633 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm37949-201ENSMUST00000192808 2091 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Klhl5-201ENSMUST00000101191 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm24327-201ENSMUST00000175108 78 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 4933406F09Rik-202ENSMUST00000180508 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Coro7-201ENSMUST00000038552 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Kif1b-201ENSMUST00000030806 6991 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Creb1-202ENSMUST00000087366 8364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Zfp677-202ENSMUST00000162659 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Hnrnpk-205ENSMUST00000176207 2653 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Slc25a35-201ENSMUST00000018884 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Prkar2b-203ENSMUST00000146865 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Zfp148-201ENSMUST00000089677 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Heatr9-201ENSMUST00000019069 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Extl2-201ENSMUST00000029575 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Atp6ap2-201ENSMUST00000033313 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm42895-201ENSMUST00000200761 2996 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Dlc1-206ENSMUST00000163663 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Rpusd2Q149F1 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Nme8-201ENSMUST00000039340 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Kpna3-201ENSMUST00000022496 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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Rpusd2Q149F1 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm12455-201ENSMUST00000121242 416 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm11722-201ENSMUST00000138702 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm26184-201ENSMUST00000157686 131 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rpusd2Q149F1 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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