Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P58686 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P58686 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P58686 AC154028.1-201ENSMUST00000217071 379 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P58686 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P58686 AC153937.2-202ENSMUST00000219583 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P58686 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P58686 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
P58686 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P58686 Arl15-202ENSMUST00000224068 1002 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P58686 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P58686 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P58686 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
P58686 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P58686 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
P58686 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P58686 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P58686 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P58686 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P58686 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P58686 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P58686 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
P58686 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
P58686 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
P58686 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P58686 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
P58686 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P58686 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
P58686 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Sav1-201ENSMUST00000021467 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm14143-201ENSMUST00000121686 357 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Bnip1-206ENSMUST00000135824 629 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm24325-201ENSMUST00000175344 74 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Uchl1os-202ENSMUST00000177319 505 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm29453-201ENSMUST00000186428 1279 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Ing5-203ENSMUST00000190476 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Kmt5a-212ENSMUST00000198451 1032 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm30835-201ENSMUST00000198825 689 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm8623-201ENSMUST00000071573 436 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gzmk-202ENSMUST00000122399 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 Gm7364-201ENSMUST00000188760 1501 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
P58686 AC160138.2-201ENSMUST00000220255 1531 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms